Academia Bohemica v současné době nabízí studium filosofie. V průběhu kurzů posluchač může projít studiem všech základních filosofických disciplín. Studenti se v nich postupně seznámí s rozsáhlou problematikou, v níž nebudou chybět velká témata, která souvisejí se smyslem a přirozeným řádem života. Ve studiu přitom půjde více o hledání pravdivých závěrů než o to, jak dané otázky ten který filosof řešil.
Výuka filosofie je rozdělen do následujících samostatných kurzů, které jsou dále členěny do dílčích lekcí. Časová náročnost odpovídá zhruba tříletému vysokoškolskému studiu. Kurzy jsou koncipovány jako dvousemestrální. Pouze Ontologie a Filosofie Boha mají rozsah tří semestrů a Uvod do filosofie tvoří jen 5 přednášek. Posloupnost a doba studia jednotlivých modulů je však jen na volbě studenta. Následující schéma, naznačující návaznosti témat jednotlivých kurzů, má sloužit pouze k orientaci. Uchazeč se může do kurzů hlásit v libovolném pořadí.